Protein–RNA interactions for Protein: O95521

PRAMEF1, PRAME family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF1O95521 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRAMEF1O95521 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF1O95521 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF1O95521 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms