Protein–RNA interactions for Protein: O95248

SBF1, Myotubularin-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBF1O95248 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SBF1O95248 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SBF1O95248 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SBF1O95248 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SBF1O95248 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SBF1O95248 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SBF1O95248 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SBF1O95248 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SBF1O95248 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SBF1O95248 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SBF1O95248 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SBF1O95248 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SBF1O95248 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SBF1O95248 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SBF1O95248 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SBF1O95248 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SBF1O95248 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SBF1O95248 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SBF1O95248 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SBF1O95248 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SBF1O95248 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SBF1O95248 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SBF1O95248 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SBF1O95248 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SBF1O95248 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SBF1O95248 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SBF1O95248 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SBF1O95248 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SBF1O95248 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SBF1O95248 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SBF1O95248 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SBF1O95248 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SBF1O95248 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SBF1O95248 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SBF1O95248 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SBF1O95248 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SBF1O95248 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SBF1O95248 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SBF1O95248 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SBF1O95248 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SBF1O95248 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SBF1O95248 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SBF1O95248 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SBF1O95248 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SBF1O95248 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SBF1O95248 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SBF1O95248 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SBF1O95248 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SBF1O95248 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SBF1O95248 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SBF1O95248 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SBF1O95248 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SBF1O95248 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SBF1O95248 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SBF1O95248 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SBF1O95248 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SBF1O95248 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SBF1O95248 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SBF1O95248 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SBF1O95248 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SBF1O95248 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SBF1O95248 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SBF1O95248 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SBF1O95248 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SBF1O95248 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SBF1O95248 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SBF1O95248 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SBF1O95248 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SBF1O95248 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SBF1O95248 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SBF1O95248 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SBF1O95248 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SBF1O95248 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SBF1O95248 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SBF1O95248 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SBF1O95248 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SBF1O95248 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SBF1O95248 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SBF1O95248 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SBF1O95248 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SBF1O95248 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SBF1O95248 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SBF1O95248 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SBF1O95248 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SBF1O95248 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SBF1O95248 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SBF1O95248 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SBF1O95248 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SBF1O95248 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SBF1O95248 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SBF1O95248 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SBF1O95248 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SBF1O95248 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBF1O95248 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBF1O95248 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBF1O95248 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBF1O95248 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBF1O95248 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SBF1O95248 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SBF1O95248 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms