Protein–RNA interactions for Protein: O94988

FAM13A, Protein FAM13A, humanhuman

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13AO94988 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FAM13AO94988 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM13AO94988 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM13AO94988 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms