Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
BBOX1O75936 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BBOX1O75936 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BBOX1O75936 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BBOX1O75936 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BBOX1O75936 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms