Protein–RNA interactions for Protein: O75396

SEC22B, Vesicle-trafficking protein SEC22b, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22BO75396 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEC22BO75396 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEC22BO75396 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC22BO75396 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms