Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA2O43921 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA2O43921 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EFNA2O43921 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EFNA2O43921 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
EFNA2O43921 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms