Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRPF3O43395 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PRPF3O43395 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRPF3O43395 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms