Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR1CO15160 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1CO15160 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22■■□□□ 1.11
POLR1CO15160 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms