Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF3FO00303 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EIF3FO00303 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF3FO00303 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms