Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SNAP23O00161 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNAP23O00161 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNAP23O00161 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms