Protein–RNA interactions for Protein: O00160

MYO1F, Unconventional myosin-If, humanhuman

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1FO00160 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MYO1FO00160 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO1FO00160 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO1FO00160 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO1FO00160 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO1FO00160 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO1FO00160 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO1FO00160 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO1FO00160 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO1FO00160 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MYO1FO00160 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYO1FO00160 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYO1FO00160 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYO1FO00160 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MYO1FO00160 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MYO1FO00160 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MYO1FO00160 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms