Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEDD8-MDP1E9PL57 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEDD8-MDP1E9PL57 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms