Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UPK3BL2E5RIL1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPK3BL2E5RIL1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UPK3BL2E5RIL1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms