Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP17L13C9JLJ4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP17L13C9JLJ4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP17L13C9JLJ4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP17L13C9JLJ4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP17L13C9JLJ4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L13C9JLJ4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L13C9JLJ4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L13C9JLJ4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L13C9JLJ4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L13C9JLJ4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L13C9JLJ4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L13C9JLJ4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L13C9JLJ4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L13C9JLJ4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP17L13C9JLJ4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
USP17L13C9JLJ4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP17L13C9JLJ4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP17L13C9JLJ4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP17L13C9JLJ4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP17L13C9JLJ4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP17L13C9JLJ4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP17L13C9JLJ4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP17L13C9JLJ4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP17L13C9JLJ4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
USP17L13C9JLJ4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP17L13C9JLJ4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP17L13C9JLJ4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP17L13C9JLJ4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP17L13C9JLJ4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP17L13C9JLJ4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP17L13C9JLJ4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
USP17L13C9JLJ4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP17L13C9JLJ4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP17L13C9JLJ4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP17L13C9JLJ4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP17L13C9JLJ4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP17L13C9JLJ4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
USP17L13C9JLJ4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP17L13C9JLJ4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
USP17L13C9JLJ4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms