Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PATL2C9JE40 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PATL2C9JE40 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PATL2C9JE40 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PATL2C9JE40 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PATL2C9JE40 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PATL2C9JE40 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
PATL2C9JE40 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PATL2C9JE40 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PATL2C9JE40 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PATL2C9JE40 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PATL2C9JE40 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PATL2C9JE40 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PATL2C9JE40 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PATL2C9JE40 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PATL2C9JE40 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PATL2C9JE40 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PATL2C9JE40 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PATL2C9JE40 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PATL2C9JE40 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164 ms