Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMCO5BA8MYB1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMCO5BA8MYB1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMCO5BA8MYB1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms