Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA5

DRGX, Dorsal root ganglia homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DRGXA6NNA5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DRGXA6NNA5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DRGXA6NNA5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DRGXA6NNA5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DRGXA6NNA5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DRGXA6NNA5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DRGXA6NNA5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DRGXA6NNA5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DRGXA6NNA5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DRGXA6NNA5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DRGXA6NNA5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DRGXA6NNA5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DRGXA6NNA5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DRGXA6NNA5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DRGXA6NNA5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DRGXA6NNA5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DRGXA6NNA5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DRGXA6NNA5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DRGXA6NNA5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DRGXA6NNA5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DRGXA6NNA5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DRGXA6NNA5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DRGXA6NNA5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DRGXA6NNA5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DRGXA6NNA5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DRGXA6NNA5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DRGXA6NNA5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DRGXA6NNA5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DRGXA6NNA5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DRGXA6NNA5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DRGXA6NNA5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DRGXA6NNA5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DRGXA6NNA5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DRGXA6NNA5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DRGXA6NNA5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DRGXA6NNA5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DRGXA6NNA5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DRGXA6NNA5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DRGXA6NNA5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DRGXA6NNA5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DRGXA6NNA5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DRGXA6NNA5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DRGXA6NNA5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DRGXA6NNA5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DRGXA6NNA5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DRGXA6NNA5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DRGXA6NNA5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms