Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A6NL46 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A6NL46 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A6NL46 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A6NL46 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A6NL46 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A6NL46 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A6NL46 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A6NL46 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A6NL46 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
A6NL46 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A6NL46 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A6NL46 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A6NL46 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A6NL46 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A6NL46 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A6NL46 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A6NL46 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
A6NL46 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A6NL46 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
A6NL46 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A6NL46 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A6NL46 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A6NL46 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A6NL46 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A6NL46 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A6NL46 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A6NL46 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A6NL46 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
A6NL46 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A6NL46 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A6NL46 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A6NL46 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A6NL46 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
A6NL46 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
A6NL46 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
A6NL46 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A6NL46 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A6NL46 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
A6NL46 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A6NL46 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A6NL46 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
A6NL46 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A6NL46 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A6NL46 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A6NL46 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A6NL46 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A6NL46 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A6NL46 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
A6NL46 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A6NL46 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A6NL46 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A6NL46 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A6NL46 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
A6NL46 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
A6NL46 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A6NL46 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A6NL46 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A6NL46 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A6NL46 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A6NL46 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A6NL46 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A6NL46 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A6NL46 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A6NL46 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A6NL46 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A6NL46 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A6NL46 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A6NL46 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A6NL46 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A6NL46 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A6NL46 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A6NL46 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A6NL46 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A6NL46 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A6NL46 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A6NL46 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
A6NL46 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A6NL46 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A6NL46 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A6NL46 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
A6NL46 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A6NL46 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A6NL46 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A6NL46 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A6NL46 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A6NL46 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A6NL46 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A6NL46 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A6NL46 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A6NL46 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A6NL46 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
A6NL46 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A6NL46 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A6NL46 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A6NL46 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A6NL46 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A6NL46 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A6NL46 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A6NL46 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms