Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF1

SAC3D1, SAC3 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAC3D1A6NKF1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAC3D1A6NKF1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAC3D1A6NKF1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAC3D1A6NKF1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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