Protein–RNA interactions for Protein: A6NHQ4

EPOP, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOPA6NHQ4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPOPA6NHQ4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPOPA6NHQ4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms