Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN8

Putative ubiquitin-like protein FUBI-like protein ENSP00000310146, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NDN8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A6NDN8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A6NDN8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A6NDN8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A6NDN8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A6NDN8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A6NDN8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A6NDN8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A6NDN8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A6NDN8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A6NDN8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A6NDN8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A6NDN8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A6NDN8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A6NDN8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A6NDN8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A6NDN8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A6NDN8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A6NDN8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A6NDN8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A6NDN8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A6NDN8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A6NDN8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A6NDN8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A6NDN8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A6NDN8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A6NDN8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A6NDN8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A6NDN8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A6NDN8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A6NDN8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A6NDN8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A6NDN8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A6NDN8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NDN8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NDN8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NDN8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NDN8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NDN8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NDN8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NDN8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NDN8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NDN8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NDN8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NDN8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NDN8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A6NDN8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NDN8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NDN8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NDN8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NDN8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NDN8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NDN8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NDN8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NDN8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NDN8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NDN8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NDN8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NDN8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NDN8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NDN8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NDN8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
A6NDN8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
A6NDN8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
A6NDN8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
A6NDN8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
A6NDN8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
A6NDN8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NDN8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NDN8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NDN8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NDN8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NDN8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NDN8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NDN8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NDN8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NDN8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NDN8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NDN8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NDN8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
A6NDN8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A6NDN8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A6NDN8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A6NDN8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A6NDN8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A6NDN8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A6NDN8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A6NDN8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A6NDN8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
A6NDN8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
A6NDN8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A6NDN8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A6NDN8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
A6NDN8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A6NDN8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A6NDN8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A6NDN8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A6NDN8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
A6NDN8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
A6NDN8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms