Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XIRP2A4UGR9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XIRP2A4UGR9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms