Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
E2F8A0AVK6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
E2F8A0AVK6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms