Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVQ0

SPAAR, Small regulatory polypeptide of amino acid response, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAARA0A1B0GVQ0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPAARA0A1B0GVQ0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SPAARA0A1B0GVQ0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPAARA0A1B0GVQ0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms