Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC12A4Q9UP95 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms