Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LHX3Q9UBR4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LHX3Q9UBR4 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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