Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHPF2Q9P2E5 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms