Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD5Q9P267 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD5Q9P267 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 364.6 ms