Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LMBRD1Q9NUN5 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LMBRD1Q9NUN5 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms