Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms