Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00597Q9H2U6 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms