Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCSER1Q9C0I3 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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