Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BCO2Q9BYV7 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms