Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RAB11FIP5Q9BXF6 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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RAB11FIP5Q9BXF6 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RAB11FIP5Q9BXF6 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RAB11FIP5Q9BXF6 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RAB11FIP5Q9BXF6 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RAB11FIP5Q9BXF6 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB11FIP5Q9BXF6 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RAB11FIP5Q9BXF6 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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