Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEMA3CQ99985 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms