Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPS6KC1Q96S38 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms