Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRIQ1Q96JM4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRIQ1Q96JM4 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms