Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN23Q96B33 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN23Q96B33 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms