Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3CQ92520 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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