Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIEQ8NEW7 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIEQ8NEW7 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIEQ8NEW7 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIEQ8NEW7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIEQ8NEW7 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIEQ8NEW7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIEQ8NEW7 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIEQ8NEW7 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIEQ8NEW7 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIEQ8NEW7 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMIEQ8NEW7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIEQ8NEW7 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMIEQ8NEW7 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMIEQ8NEW7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMIEQ8NEW7 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMIEQ8NEW7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMIEQ8NEW7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMIEQ8NEW7 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMIEQ8NEW7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMIEQ8NEW7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMIEQ8NEW7 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms