Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ZNF248Q8NDW4 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms