Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPAP2Q8IXW5 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms