Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SCN4BQ8IWT1 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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