Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC117Q8IWD4 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms