Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PLD3Q8IV08 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms