Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF549Q6P9A3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF549Q6P9A3 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 306.9 ms