Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MED27Q6P2C8 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms