Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC9A4Q6AI14 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms