Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WSCD1Q658N2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms