Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PTPRNQ16849 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms